Bibliografický průzkum byl proveden již ve všech významných pražských knihovnách s historickými fondy a v současnosti probíhá nebo je dokončen v přibližně 40 institucích mimopražských (knihovny, archivy, galerie). V seznamu nejsou uvedeny knihovny, v nichž byla pro BCBT zjišťována pouze vydání spisů Bohuslava Balbína a J. A. Komenského v rámci přednostní přípravy personálních bibliografií těchto autorů.
PRAHA
- Národní knihovna v Praze – excerpována bohemika v celé šíři, signatury připsány, nově zjištěná vydání popsána (na starších popisech signatury uvozeny zkratkou UK, později SK, NK).
- Knihovna Národního muzea – excerpována cizojazyčná bohemika v celé šíři (v seznamech dochovaných exemplářů se její signatury objevují uvozeny převážně zkratkou KNM),
- zámecké knihovny spravované Knihovnou Národního muzea – cizojazyčná bohemika excerpována z lokálních katalogů, jež neumožňují spolehlivě dodržet kritérium obsahové, event. autorské; u poloviny excerpt signatury připsány, bibliograficky popsána pouze část nově zjištěných vydání; současné deponování exemplářů nutno konzultovat v oddělení zámeckých knihoven Knihovny Národního muzea, neboť řada fondů byla restituována (u signatur následuje za zkratkou KNM název fondu).
- Strahovská knihovna Kláštera premonstrátů – excerpována cizojazyčná bohemika v celé šíři, signatury připsány, nově zjištěná vydání popsána (u většiny signatur zkratkaStrahov. k., řidčeji zkratka Památníku národního písemnictví – PNP).
- Knihovna Památníku národního písemnictví – excerpována cizojazyčná bohemika v celé šíři, signatury připsány, nově zjištěná vydání popsána (dnes je v ní nutno hledat především tisky z tzv. Karáskovy galerie se signaturami „Kar. gal.“ uvedenými za zkratkou Strahov. k. nebo PNP).
- Knihovna Královské kolegiátní kapituly sv. Petra a Pavla na Vyšehradě – excerpována cizojazyčná bohemika v celé šíři, připsány všechny signatury, bibliograficky popsány nově zjištěné výtisky domácí tiskařské produkce 16. a 17. století (signatury uvozeny zkratkou Strahov. k. nebo PNP, za níž následuje Vyš. kap.).
- Knihovna františkánů – excerpována cizojazyčná bohemika v celé šíři, signatury připsány, nově zjištěná vydání popsána (na starších popisech signatury uváděny pod zkratkami Národní knihovny – UK, SK následovanými názvem řádu).
- Knihovna křižovníků s červenou hvězdou – excerpována cizojazyčná bohemika v celé šíři, signatury připsány, nově zjištěná vydání popsána (na starších popisech signatury uváděny pod zkratkami Národní knihovny – UK, SK následovanými názvem řádu).
- Knihovna dominikánů – excerpována cizojazyčná bohemika v celé šíři, signatury připsány, nově zjištěná vydání popsána (na starších popisech signatury uváděny pod zkratkami Národní knihovny – UK, SK následovanými názvem řádu).
- Knihovna benediktinů – excerpována cizojazyčná bohemika v celé šíři, signatury připsány, popsány tisky ze 16. století (na starších popisech signatury uváděny pod zkratkami Národní knihovny – UK, SK následovanými názvem řádu).
- Knihovna augustiniánů – excerpována cizojazyčná bohemika v celé šíři, signatury z části připsány, popsány výtisky nově zjištěných vydání ze 16. století (na starších popisech signatury uváděny pod zkratkami Národní knihovny – UK, SK následovanými názvem řádu).
- Knihovna Metropolitní kapituly – excerpována bohemika v celé šíři, signatury připsány, bibliograficky popsána nově zjištěná vydání tiskařských bohemik 16. a 17. století (na popisech signatury uváděny většinou zkráceným názvem K. metropol. kap.).
- Knihovna Astronomického ústavu AV ČR – excerpována cizojazyčná bohemika v celé šíři, signatury připsány, nově zjištěná vydání popsána.
- Knihovna Akademie věd ČR – excerpována cizojazyčná bohemika v celé šíři signatury připsány (s tehdejší zkratkou ZK nebo ZK-ÚVI), nově zjištěná vydání popsána.
- Knihovna poslanecké sněmovny v Praze – excerpována cizojazyčná bohemika v celé šíři, signatury připsány (Parlamentní knihovna).
- Knihovna Evangelické teologické fakulty UK v Praze (též někde nesprávně jako Knihovna Husova domu) – excerpována cizojazyčná bohemika v celé šíři, signatury připsány, nově zjištěná vydání popsána.
- Knihovna Historického ústavu Armády ČR v Praze (HÚ AČR) – excerpována tiskařská bohemika 16.–18. století, signatury připsány, nově zjištěná vydání popsána.
- Státní technická knihovna
– excerpována cizojazyčná bohemika v celé šíři, signatury připsány.
MIMOPRAŽSKÉ KNIHOVNY
Čáslav
- Městské muzeum – excerpována cizojazyčná tiskařská bohemika 16.–18. století, signatury připsány.
Česká Lípa
- Vlastivědné (dříve Okresní vlastivědné) muzeum – excerpována tiskařská bohemika 16.–18. století z knihovny augustiniánů, většina signatur připsána, část nově nalezených bohemik popsána.
České Budějovice
- Jihočeské muzeum – excerpována cizojazyčná bohemika 16. a 17. století, signatury připsány.
Choceň
- Orlické (dříve Městské) muzeum – excerpována cizojazyčná bohemika 16.–18. století, signatury připsány.
Chotěboř
- Městské muzeum – excerpována cizojazyčná bohemika 16.–18. století, signatury připsány, nově zjištěné tisky popsány.
Jihlava
- Muzeum Vysočiny – excerpována cizojazyčná bohemika 16.–18. století, signatury připsány, nově zjištěná vydání popsána.
Litoměřice
- Biskupská knihovna – excerpována cizojazyčná bohemika 16.–18. století, signatury připsány, část nově zjištěných vydání popsána.
- Oblastní (dříve Okresní vlastivědné) muzeum – excerpována cizojazyčná bohemika 16.–18. století, signatury připsány.
Litomyšl
- Státní okresní archiv Svitavy se sídlem v Litomyšli – excerpována cizojazyčná bohemika 16.–18. století, signatury připsány.
- Muzeum a galerie – excerpována cizojazyčná bohemika 16.–18. století, signatury připsány.
Louny
- Oblastní muzeum, fond knihovny augustiniánského kláštera z Dolního Ročova – bohemika excerpována v celé šíři, signatury připsány, nově zjištěná vydání 16. a 17. století popsána.
Mělník
- Státní okresní archiv – excerpována cizojazyčná bohemika 16.–18. století, signatury připsány.
- Regionální (dříve Okresní) muzeum –excerpována cizojazyčná bohemika 16.–18. století, signatury připsány.
Mikulov
- Státní okresní archiv Břeclav se sídlem v Mikulově – excerpována cizojazyčná bohemika 16.–18. století, signatury připsány.
Mladá Boleslav
- Státní okresní archiv – excerpována tiskařská bohemika 16. a 17. století z bývalé knihovny piaristů, signatury připsány.
Most
- Oblastní muzeum– excerpována bohemika v celé šíři, signatury připsány, nově zjištěná vydání popsána.
Nelahozeves
- Roudnická Lobkowiczká knihovna – excerpována a popsána bohemika v celé šíři (signatury dochovaných exemplářů jsou na starších popisech pod zkratkou Národní knihovny – UK, SK nebo NK, uvozeny Roudn.)
Olomouc
- Vědecká knihovna (dříve Státní vědecká knihovna – zkratka SVK) – excerpována cizojazyčná tiskařská bohemika 16.–18. století, signatury připsány, bibliograficky popsány tisky s vedutami.
Plzeň
- Studijní a vědecká knihovna Plzeňského kraje (dříve Státní vědecká knihovna – zkratka SVK) – částečně excerpována cizojazyčná bohemika podle všech kritérií z klášterní knihovny františkánů, signatury připsány.
Polná
- Muzeum (dříve Městské) Polná – excerpována cizojazyčná bohemika 16.–18. století, signatury připsány.
Rokycany
- Muzeum Dr. Bohuslava Horáka (dříve Okresní muzeum) – excerpována cizojazyčná bohemika 16.–18. století, signatury připsány.
Rychnov nad Kněžnou
- Okresní muzeum Orlických hor – excerpována cizojazyčná bohemika 16.–18. století, signatury připsány.
Soběslav
- Husitské muzeum v Táboře, pobočka (dříve Muzeum husitského revolučního hnutí Tábor) – excerpována tiskařská bohemika 16.–18. století, většina signatur připsána.
Strakonice
- Muzeum středního Pootaví – excerpována cizojazyčná bohemika 16.–18. století, signatury připsány.
Třebíč
- Státní okresní archiv – excerpována cizojazyčná bohemika 16.–18. století, signatury připsány.
- Muzeum Vysočiny (dříve Západomoravské muzeum) – excerpována cizojazyčná bohemika 16.–18. století, signatury připsány.
Velká Bíteš
- Městské muzeum – excerpována cizojazyčná bohemika 16.–18. století, signatury připsány.
Vlašim
- Muzeum Podblanicka (dříve Okresní muzeum Benešov, pobočka) – excerpována cizojazyčná bohemika 16.–18. století, signatury připsány.
Vysoké Mýto
- Regionální (dříve Okresní) muzeum – excerpována tiskařská bohemika 16.–18. století, signatury připsány.
Zdiby
- Státní okresní archiv Praha-východ (dříve v Nehvizdech) – excerpována cizojazyčná bohemika 16.–18. století, signatury připsány.
ZAHRANIČNÍ KNIHOVNY
Maďarsko
Budapest
- Akadémiai Könyvtára – excerpována a popsána tiskařská bohemika 16. a 17. století.
- Országos Széchényi Könyvtár – excerpována a popsána tiskařská bohemika 16. a 17. století.
Polsko
Cieszyn
- Biblioteka Cieszyńska – excerpována tiskařská bohemika 16.–18. století, většina signatur připsána.
- Biblioteka Tschammera – excerpována tiskařská bohemika 16.–18. století, většina signatur připsána.
- Biblioteka Dekanatu – excerpována tiskařská bohemika 16.–18. století, většina signatur připsána.
- Muzeum Cieszyn – excerpována tiskařská bohemika 16.–18. století, signatury připsány.
Itálie
Roma
- Biblioteca Angelica – excerpována a popsána tiskařská bohemika 16.–18. století.
- Biblioteca Vaticana – excerpována a popsána tiskařská bohemika 16.–18. století.
Švédsko
Stockholm
- Kungliga biblioteket – excerpována tiskařská bohemika do 1. desetiletí 17. století podle katalogu bývalé rožmberské knihovny, signatury připsány, nová bohemika popsána
Strängnäs
- Domkyrkobilioteket – excerpována tiskařská bohemika do 1. desetiletí 17. století podle katalogu bývalé rožmberské knihovny, signatury připsány.
Västerås
- Stifts- och landsbiblioteket – excerpována tiskařská bohemika do 1. desetiletí 17. století podle katalogu bývalé rožmberské knihovny, signatury připsány.
Rakousko
Wien
- Österreichische Nationalbibliothek – excerpována tiskařská bohemika 16.–17. století, signatury připsány, bibliograficky popsány tisky s vedutami.
Německo
Wolfenbüttel
- Herzog August Bibliothek – excerpována tiskařská bohemika 16.–18. století, signatury připsány, nově zjištěná bohemika popsána z 90 procent.